Una gran noticia. Cient¨ªficos del Laboratorio de Virus Respiratorios del Centro Nacional de Microbiolog¨ªa (CNM) del Instituto de Salud Carlos III (ISCIII) han realizado la secuenciaci¨®n completa del nuevo coronavirus SARS-CoV-2 gracias al uso de muestras respiratorias de pacientes procedentes de diferentes ¨¢reas geogr¨¢ficas de Espa?a.

Seg¨²n explica Mar¨ªa Iglesias, investigadora del citado laboratorio, se ha logrado la secuencia del virus completo gracias al uso de nuevos m¨¦todos de trabajo optimizados y desarrollados en el CNM para la secuenciaci¨®n completa del virus, entre los que se incluyen nuevos procesos de an¨¢lisis bioinform¨¢tico para la obtenci¨®n de las secuencias gen¨®micas del SARS-CoV-2.

De acuerdo al conocimiento actual del virus, las secuencias del SARS-CoV-2 se agrupan en 9 ¡®clados¡¯ distintos. Los clados son grupos filogen¨¦ticos que definen la evoluci¨®n biol¨®gica de un organismo, y en ellos se pueden observan las diferencias gen¨¦ticas de los coronavirus circulantes de todo el mundo, que explican c¨®mo act¨²a y se comporta. Seg¨²n han determinado los investigadores del CNM, las secuencias espa?olas del SARS-CoV-2 se han relacionado en 3 clados diferentes, denominados S, G y V.

Muestras de diferente procedencia

El estudio de secuenciaci¨®n se ha realizado directamente sobre muestras cl¨ªnicas del virus (no con cultivos de laboratorio) con apoyo de las Unidades de Bioinform¨¢tica y Gen¨®mica del CNM. Se ha llevado a cabo con muestras cl¨ªnicas procedentes de:

- Pa¨ªs Vasco.

- Madrid.

- Andaluc¨ªa.

- Castilla-La Mancha.

- Castilla y Le¨®n.

- Catalu?a.

- Galicia.

La amplitud de muestras permite observar un mapa de la circulaci¨®n y caracter¨ªsticas de circulaci¨®n del virus por toda Espa?a. Entre otras cuestiones, el an¨¢lisis realizado permite caracterizar c¨®mo se relacionan las diferentes secuencias publicadas hasta el momento, tanto entre s¨ª como con secuencias internacionales, y aporta nuevo conocimiento sobre la circulaci¨®n del virus a nivel auton¨®mico y nacional.

Tambi¨¦n revela informaciones m¨¢s concretas, como la ubicaci¨®n de secuencias procedentes de Andaluc¨ªa en un clado distinto al del resto de secuencias espa?olas, que se asocian filogen¨¦ticamente con secuencias procedentes de virus analizados en pacientes ingleses.

En Espa?a hay otras iniciativas en torno a la secuenciaci¨®n completa del nuevo coronavirus, como, entre otras, la de la Comunidad de Madrid y un proyecto liderado por la Fundaci¨®n Fisabio de la Comunidad Valenciana, que ya obtuvo hace unas semanas una primera secuenciaci¨®n del virus, en su caso obtenido de tres muestras de un mismo hospital.