Misteriosa se?al del coronavirus encontrada en Nueva York

El coronavirus se analiza por todas partes, y en Nueva York tambi¨¦n estudian las aguas residuales como indicador de la pandemia (en 14 plantas de la ciudad). Llevan m¨¢s de un a?o encontrando misterioros ¡®restos¡¯ de coronavirus, linajes que no han sido detectados en humanos por m¨¢s que han analizado muestras de todo tipo. Una de las teor¨ªas de los investigadores es que pueden ser de animales, posiblemente de ratas dada la gran colonia de este animal en la Gran Manzana, seg¨²n han contado al diario The New York Times.

La investigaci¨®n se acaba de publicar en Nature, ¡°aqu¨ª informamos la detecci¨®n de frecuencias crecientes de nuevos linajes cr¨ªpticos de SARS-CoV-2 no reconocidos en la base de datos EpiCoV de GISAID. Estos linajes contienen mutaciones que rara vez se hab¨ªan observado en muestras cl¨ªnicas, incluidos Q493K, Q498Y, E484A y T572N, y comparten muchas mutaciones con la variante preocupante de ?micron¡±.

Las posibles teor¨ªas de los linajes sin due?o

A la teor¨ªa de animales infectados, como ratas o ratones, se une la posibilidad de que estos linajes se deriven de infecciones humanas por COVID-19 no muestreadas o que indiquen la presencia de un reservorio animal no humano.

¡°Adem¨¢s de los linajes bien reconocidos, las muestras conten¨ªan secuencias RBD con constelaciones consistentes de polimorfismos detectados durante varios meses que no coincid¨ªan con los linajes informados en GISAID. Aqu¨ª nos referimos a estas constelaciones de mutaciones vinculadas en las secuencias de RBD como linajes (lo que significa que son descendientes comunes), aunque sin tener la secuencia completa del genoma no podemos decir si se derivaron de un solo linaje o de m¨²ltiples linajes con el mismo RBD. Estos linajes cr¨ªpticos no eran est¨¢ticos, ya que varios de ellos parec¨ªan adquirir polimorfismos adicionales durante el per¨ªodo de muestreo¡±.

El dato m¨¢s curioso, ¡°a medida que la concentraci¨®n de material gen¨¦tico del SARS-CoV-2 de las aguas residuales de la ciudad de Nueva York disminuy¨® junto con la disminuci¨®n de pacientes con COVID, la fracci¨®n de las secuencias totales de estos linajes aument¨® proporcionalmente¡±.

?De d¨®nde son esos linajes?

¡°La existencia de estos linajes cr¨ªpticos puede apuntar a infecciones por COVID-19 de pacientes humanos que no est¨¢n siendo muestreados a trav¨¦s de los esfuerzos de secuenciaci¨®n cl¨ªnica est¨¢ndar. La frecuencia de casos semanales confirmados en la ciudad de Nueva York que fueron secuenciados vari¨® del 2,6 % el 31 de enero de 2021 al 12,9 % el 12 de junio de 2021. Sin embargo, no todos los casos fueron diagnosticados y no todas las muestras positivas fueron secuenciadas. Por lo tanto, no se puede descartar que los linajes puedan derivarse de pacientes, que no est¨¢n siendo muestreados en entornos cl¨ªnicos¡±.

Monica Trujillo, microbi¨®loga del Queensborough Community College y autora del nuevo art¨ªculo, afirma que ¡°en este punto, lo que podemos decir es que no hemos encontrado los linajes cr¨ªpticos en las bases de datos humanas, y hemos buscado por todas partes¡±.

El origen de ?micron

Muchos cient¨ªficos creen que ?micron surgi¨® de un paciente inmunocomprometido. Curiosamente, algunos de los linajes cr¨ªpticos tienen algunas de las mismas mutaciones que Omicron, o mutaciones en los mismos lugares. Los experimentos de laboratorio sugieren que estos linajes tambi¨¦n pueden evadir algunos anticuerpos.

Los linajes de la ciudad de Nueva York podr¨ªan ser el resultado del mismo tipo de presi¨®n selectiva para evadir algunas de las defensas inmunitarias del cuerpo, teorizan los investigadores. Mientras siguen buscando de qu¨¦ tipo de animal pueden ser los linajes encontrados, les resulta tremendamente extra?o que con la alta incidencia y secuenciaci¨®n de muestras humanas, no coincida con ninguna, ni en hospitales, ni centros, ni residencias donde los pacientes pueden tener una salud m¨¢s vulnerable.?