El intestino humano alberga 140.000 virus, 70.000 desconocidos hasta ahora
Un nuevo estudio, a cargo del Instituto Wellcome Sanger y del Instituto Europeo de Bioinform¨¢tica, abre importantes v¨ªas de investigaci¨®n para comprender c¨®mo los virus que viven en el intestino afectan la salud humana.
Los virus son las entidades biol¨®gicas m¨¢s numerosas del planeta y los que conforman el microbioma intestinal, que tambi¨¦n incluye bacterias y hongos, desempe?an un papel fundamental en determinados procesos metab¨®licos o de regulaci¨®n del sistema inmunitario, entre otros, cuya relevancia para la salud est¨¢ fuera de toda duda. Aunque a¨²n hay espacio para la investigaci¨®n y para la sorpresa.
Y es que, un reciente trabajo, a cargo de expertos del Instituto Wellcome Sanger y el Instituto Europeo de Bioinform¨¢tica (EMBL-EBI), ambos ubicados en el Reino Unido, ha identificado m¨¢s de 140.000 especies virales que viven en el intestino humano, m¨¢s de la mitad de las cuales nunca antes se hab¨ªan visto. Los resultados, publicados en la revista Cell, son fruto de un exhaustivo an¨¢lisis de m¨¢s de 28,000 muestras de microbioma intestinal recolectadas en diferentes partes del mundo.
La cantidad y diversidad de virus que encontraron los investigadores fue sorprendentemente alta, y los datos abren nuevas v¨ªas de investigaci¨®n para comprender c¨®mo los virus que viven en el intestino afectan la salud humana. No en vano, el intestino humano es un entorno con una biodiversidad incre¨ªble. Adem¨¢s de las bacterias, cientos de miles de virus llamados bacteri¨®fagos, que pueden infectar bacterias, tambi¨¦n viven en el intestino humano.
Se sabe que los desequilibrios en nuestro microbioma intestinal pueden contribuir a enfermedades y afecciones complejas como la enfermedad inflamatoria intestinal, las alergias y la obesidad. Pero se sabe relativamente poco sobre el papel que juegan nuestras bacterias intestinales y los bacteri¨®fagos que las infectan en la salud y las enfermedades humanas.
La voz de los expertos
- ¡°Un aspecto importante de nuestro trabajo fue asegurarnos de que los genomas virales reconstruidos fueran de la m¨¢s alta calidad. Una estricta l¨ªnea de control de calidad junto con un enfoque de aprendizaje autom¨¢tico nos permiti¨® mitigar la contaminaci¨®n y obtener genomas virales altamente completos. Los genomas virales de alta calidad allanan el camino para comprender mejor el papel que juegan los virus en nuestro microbioma intestinal, incluido el descubrimiento de nuevos tratamientos como los antimicrobianos de origen bacteri¨®fago¡±, se?ala el doctor Luis F. Camarillo-Guerrero, principal autor de la investigaci¨®n.
- ¡°Es importante recordar que no todos los virus son da?inos, pero representan un componente integral del ecosistema intestinal. Por un lado, la mayor¨ªa de los virus que encontramos tienen ADN como material gen¨¦tico, que es diferente de los pat¨®genos que la mayor¨ªa de la gente conoce, como el SARS-CoV-2 o el Zika, que son virus de ARN. En segundo lugar, estas muestras proced¨ªan principalmente de personas sanas que no compart¨ªan ninguna enfermedad espec¨ªfica. Es fascinante ver cu¨¢ntas especies desconocidas viven en nuestro intestino y tratar de desentra?ar el v¨ªnculo entre ellas y la salud humana ", explica uno de los investigadores, el doctor Alexandre Almeida.
- ¡°La investigaci¨®n sobre bacteri¨®fagos est¨¢ experimentando un renacimiento. Este cat¨¢logo a gran escala y de alta calidad de virus intestinales humanos llega en el momento adecuado para servir como modelo para guiar el an¨¢lisis ecol¨®gico y evolutivo en futuros estudios de viromas", concluye el autor senior del estudio, el doctor Trevor Lawley.
Metodolog¨ªa y trascendencia
As¨ª, utilizando un m¨¦todo de secuenciaci¨®n de ADN llamado metagen¨®mica, los investigadores exploraron y catalogaron la biodiversidad de las especies virales que se encuentran en 28.060 metagenomas intestinales humanos p¨²blicos y 2.898 genomas aislados bacterianos cultivados intestino humano.
Los resultados del estudio forman parte de la base de datos de fagos intestinales (GPD), una base de datos que contiene 142,809 genomas de fagos no redundantes que ser¨¢n un recurso muy valioso para aquellos que estudian los bacteri¨®fagos y el papel que desempe?an en la regulaci¨®n de la salud de nuestras bacterias intestinales y nosotros mismos.