Ira Deveson, jefe del Grupo de Tecnolog¨ªas Gen¨®micas del Centro de Gen¨®mica Cl¨ªnica de Garvan de la Universidad de Nueva Gales del Sur (UNSW, siglas en ingl¨¦s) considera que ¡°cuando se identifica un nuevo caso 'desconocido' de coronavirus, cada minuto cuenta¡±. Sin embargo, el tiempo que actualmente demora la detecci¨®n de uno de esos casos es de unas 24 horas en Australia, que sufri¨® una segunda ola de COVID-19 en la ciudad de Melbourne entre junio y noviembre a ra¨ªz de presuntos fallos en los centros de cuarentena para viajeros internacionales. Este brote caus¨® la mayor¨ªa de las 28.000 infecciones y 908 muertos que acumula Australia desde que comenz¨® la pandemia.

Secuenciaci¨®n de nanoporos

Por eso, Deveson y otros cient¨ªficos de la UNSW crearon una t¨¦cnica pionera de secuenciaci¨®n gen¨®mica, r¨¢pida y de gran precisi¨®n, que ayudar¨¢ a determinar la fuente de los casos desconocidos de COVID-19 en apenas cuatro horas. Para ello, se basaron en un m¨¦todo brit¨¢nico de secuenciaci¨®n de nanoporos para identificar al SARS-CoV-2 en aquellos casos donde la fuente no est¨¢ clara mediante una reconstrucci¨®n de su historia evolutiva, as¨ª como detectar los llamados s¨²per-propagadores.

Esta nueva t¨¦cnica consiste en identificar las variaciones gen¨¦ticas que se producen en las transmisiones de la COVID-19 para establecer la relaci¨®n entre aquellos que contrajeron el virus, al tiempo que abre la posibilidad de que un futuro el rastreo gen¨®mico se realice en tiempo real, seg¨²n explica la universidad en un comunicado. ¡°Cada vez que el virus de la COVID-19 se transmite de una persona a otra comete errores de copia que modifican un par de las 30.000 letras gen¨¦ticas¡±, explic¨® Rowena Bull, del Instituto Kirby de la UNSW y coautora de este estudio publicado en la revista cient¨ªfica Nature Communications.

El centro tambi¨¦n revela que el m¨¦todo brit¨¢nico tiene la ventaja de que no tiene topes en la longitud de la secuenciaci¨®n de los fragmentos de ADN. Adem¨¢s, permite determinar la secuencia completa de un genoma viral con mayor rapidez, a diferencia de los m¨¦todos convencionales que leen hasta 150 letras por vez.

Ante las preocupaciones respecto a la exactitud de este m¨¦todo de secuenciaci¨®n de nanoporos, los investigadores de la UNSW determinaron que fue un 99% preciso en la detecci¨®n de 157 espec¨ªmenes de pacientes positivos por coronavirus.